Die Shadow Troopers waren das Vorzeigeprodukt von Armand Isard, Direktor der Republik-Militärforschung und Generaldirektor des Senat-Büros Spionage, die hauptsächlich für die Spionage und Sabotage entwickelt wurden.
Um die abnehmende Zahl von ARC- Troopern zu ersetzen, wurden die Shadow Trooper einzeln oder in Paaren auf Ihre Missionen entsandt.
Sie arbeiteten dabei im Hintergrund, stehts gut getarnt, als Söldner oder Kopfgeldjäger beispielsweise, wobei Sie niemals Ihre Rüstung ablegten, sondern sich vielmehr mit dieser tarnten. So konnten Sie in aller Ruhe die Informationen sammeln die Sie benötigten.
Ihre Rüstung war eine Weiterentwicklung der Standardklonrüstung der Phase II und erlaubte das Äussere bis zu einem gewissen Grad zu verändern. Es gab verschiedene Modifikationen derer sich ein Shadow Trooper bedienen konnte um beispielsweise die Schwarze Sonne auszuspionieren. Wenn eine Modifikation aktiviert war, imitierte Sie auch Nebensächlichkeiten – z.B. die Gehweise, oder einen Akzent von bestimmten Rassen.
Sich äusserlich zu tarnen reichte jedoch oftmals nicht, da viele grosse Organisationen auch moderne Scansysteme besaßen, mit deren Hilfe Sie Eindringlinge schnell orten konnten.
Daher imitierte der Anzug auch die Biowerte der Lebensform, die der Shadow Trooper imitieren wollte. Die Rüstung wurde hierzu auf sehr geschickte Weise mit einem Scan und Sensorreflektierendem Material überzogen und eine Härtung des Panzers konnte sogar passive EM Sensoren daran hindern die richtigen Biowerte zu erkennen.
Während der Tarnung jedoch musste der Shadow Trooper seine Rüstungsfunktionen komplett deaktivieren um nicht erkannt zu werden. Bei Bedarf konnte der Shadow Trooper jedoch an seinem Helm die Funktionen des Panzers sofort wieder aktivieren.
Der Helm der Rüstung war speziell abgeschirmt und hatte eine eigene codierte Frequenz auf welcher der Trooper mit seinen Vorgesetzten sprechen konnte. Dies war jedoch nur selten der Fall da, die Trooper ähnlich wie die ARC Trooper fast autonom arbeiten konnten.
Die Bewaffnung eines Shadow Troopers bestand aus dem DC-19 Stealth Gewehr, welches mit Reflektoren überzogen war, die bei Aktivierung die Waffe unsichtbar werden ließen, indem Sie die Umgebung auf der Waffenoberfläche wiedergaben.
Die Waffe war Tibanna-Gasgetrieben, was Sie extrem kostspielig machte, da dieses Gas selten und dementsprechend teuer ist. Durch den erzeugten Gasdruck, der beim abfeuern der Waffe erzielt wurde, wurde ein Bolzen so stark beschleunigt, dass er für die meisten Spezies mit dem bloßen Auge nicht mehr erkennbar war. Die Waffe war auch sehr leise, was zur Schattenhaftigkeit der Trooper noch besser beitrug.
Der Nachteil der Waffe bestand darin, dass Sie nach 10 Feuerstößen in kurzer Zeit, eine Ruhephase benötige, da Tibanna-Gas nach starker Erhitzung sehr instabil wird. In dieser Zeit war der Trooper dann ein leichtes Ziel für angreifende Gegner.
Eine der größten und zugleich erfolgreichsten Operationen der Shadow Troopers ereignete sich zur Zeit der Klonkriege. Als sich die Truppen der KUS auf dem Planeten Utapau versammelten wurden 6 Shadow Trooper damit beauftragt die feindliche Aufklärung auszuschalten damit die Republik überraschend zuschlagen konnte.
Dies geschah sehr erfolgreich, wie General Grievous feststellen musste. Die Droidenarmee wurde schnell von den Klonen überrannt.
Nach den Klonkriegen und dem Umwandeln der Republik in das galaktische Imperium, dienten die Shadow Trooper immer noch der Aufklärung und Sabotage und infiltrierten auf Befehl vom Imperator persönlich jedwede Einrichtung oder Organisation...