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Im Gegensatz zur regulären Armee standen die Spezialeinheiten wie Republic Commandos und ARC nicht ständig unter dem direkten Oberbefehl eines Jedi. Diese Einheiten operierten im Einsatz meistens unabhänig und auf sich alleine gestellt.
Obschon die Große Armee der Republik während der Klonkriege viele Veränderungen durchmachte, so unter anderem die Einführung neuer Waffen, neuer Rüstungen und neuer Ausbildungsmethoden, blieb der Aufbau und die Kommandostruktur der regulären Armee nahezu unverändert und setzte sich sogar bis in die Imperiale Ära fort...