Der Republik dämmert eine Zeit großer Mühsal und Pein. Die Sith-Schüler SATAL KETO und ALEEMA kehren zurück und verschwören sich zu einem Staatsstreich im Kaiserin-Teta-System. Jeder Widerstand zerbricht unter ihren neuen Sith-Machtkräften und ihren Anhängern, den KRATH. Nachrichten über den Umsturz erreichen auch ONDERON, wo ULIC und CAY QEL-DROMA, TOTT DONEETA und NOMI SUNRIDER gerade dabei sind, nach dem Freedon-Nadd-Aufstand Ruhe und Frieden wiederherzustellen. Meister ARCA entsendet Nomi und Ulic ins Kaiserin-Teta-System, und auch die Raumflotte der Republik verlegt Einheiten zu den sieben Welten, die von den Krath heimgesucht werden. Während des folgenden Raumgefechts wird die Brücke von Ulics Flaggschiff von einem Selbstmordpiloten der Krath zerstört, Ulic wird dabei schwer verletzt. Nomi gelingt es, ihn zu retten und die Streitkräfte der Republik neu zu formieren.
Währenddessen bildet Jedi-Meister VODO-SIOSK BAAS auf der weit entfernten Welt Dantuin drei Schüler aus, darunter auch den begabten EXAR KUN, den aus der Sicht Vodos ein beunruhigender Schatten umgibt. Nach einer heftigen Auseinandersetzung mit den anderen Schülern besiegt Kun Vodo in einem brutalen Lichtschwertkampf und verläßt Dantuin. Er hofft, auf Onderon mehr über den Großen Hyperraumkrieg und die Sith zu erfahren. Kun stellt sich dort als Jedi-Archäologe vor und erhält dadurch Hilfe von Cay Qel-Droma und Tott Doneeta. Meister Arcas Gunst bleibt Kun wegen seiner Arroganz jedoch verwehrt, Arca verweigert ihm jegliche Unterstützung. Kun verläßt Onderon und reist auf den Bestienmond DXUN. Dort dringen seine gedungenen Anhänger in die Gruft des Freedon Nadd ein. Große Furcht übermannt Kun, als ein Geist vor ihm erscheint. Dieser zeigt ihm wertvolle Schriftrollen, die Kun nach KORRIBAN führen, auf die Grabwelt des alten Sith-Reiches.
Kun erforscht eine Reihe beeindruckender Katakomben. Als ein Gewölbe einstürzt, wird er unter Schutt und Trümmern begraben. Kun ruft um Hilfe, worauf ihm erneut Nadds Geist erscheint. Nadd verspricht, Kun zu helfen, wenn sich dieser dafür der Dunklen Seite zuwendet. Kuns Geist schreit voller Schmerz auf. Die Wucht seiner Qual ist so groß, daß Meister Vodo auf sie aufmerksam wird, obwohl er gerade auf seinem Weg nach DENEBA ist, zur Versammlung der Zehntausend Jedi-Rittern.
Diese historische Zusammenkunft, die von dem großen Jedi-Bibliothekar ODAN-URR einberufen wurde, um einen Weg zu finden, der Bedrohung durch die Krath Herr zu werden, versinkt in Chaos, als ein ganzer Schwarm von Krath-Kriegsdroiden die Jedi angreift. Mit großem Mut und großer Tapferkeit schlagen die Jedi den Angriff zurück. Meister Arca stirbt, als er Ulic Qel-Dromas Leben rettet. Ulics Selbstzweifel wachsen zusehends. Unverfroren beschließt er, die Krath zu unterwandern. Auf Korriban befiehlt Nadd Exar Kun inzwischen, nach Yavin IV zu reisen. Dort wird Kun von den wilden Massassi gefangengenommen. Kun muß die Dunkle Seite einsetzen, um sich vor einem Tod auf dem Opferaltar zu bewahren. Noch ein letztes Mal erscheint ihm Nadds Geist. Nadd will Kun seinem Willen unterwerfen, doch dieser wendet sich aus persönlicher Machtgier der Dunklen Seite zu und vernichtet Nadd für immer. Exar Kun erklärt sich zum neuen Dunklen Lord der Sith. Die Massassi macht er zu seinen Sklaven und befiehlt ihnen, Gebäude zu errichten, um die Energie der Finsternis zu konzentrieren. Schließlich findet Kun das verschüttete Flaggschiff von Naga Sadow. Exar Kuns Macht wird stetig größer.
Die Teile IX bis XIII enthalten Vorabinformationen (Spoiler) über Knights of the Old Republic und Knights of the Old Republik II: The Sith Lords.