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Die Leitdoktrin dieses neuen Imperiums war im Kern wie eh und je Palpatines Erklärung der Neuen Ordnung, wenn auch in stark abgewandelter Form. An der Spitze des Staates stand ein Kaiser, unterstützt von einem Muftirat, der weitreichende Rechte hatte, darunter auch das Recht, Kriegserklärungen auszusprechen, und mit einem Großadmiral als Oberkommandierenden der Streitkräfte. Als Regierungssitz diente dem neuen Imperium über lange Jahre die Festungswelt Bastion - die alte Hauptwelt der Restwelten - bevor, nach der Annektion der Galaktischen Allianz, Coruscant wieder zur Hauptstadt wurde.Der offizielle Name dieses Neuen Galaktischen Imperiums blieb schlicht und einfach Galaktisches Imperium, auch wenn es im Alltag oft als Neues Imperium bezeichnet wurde. Dabei sollte die Wiederbelebung und Wiederbetonung des alten Namens den Machtanspruch, das Ansehen und den Status zum Ausdruck bringen, den das Imperium über 40 Jahre nach der Schlacht von Yavin mit der Wiedereinführung der Monarchie durch die Fel-Dynastie und den Erfolgen des "Sieg ohne Krieg"-Programms erlangt hatte.
Die Bezeichnung "Galaktisches Imperium" war dabei rein rechtlich keine Neuerung, doch mit dem Niedergang des Imperiums zwischen der Schlacht von Endor und der Invasion der Yuuzhan-Vong wurden die Überreste des Imperiums von der Neuen Republik immer häufiger als "Imperiale Restwelten" bezeichnet, während die Imperialen vom "Imperialen Raum" oder schlicht dem Imperium sprachen. Der alte galaktische Machtanspruch blieb jedoch annähernd 30 Jahre lang weitestgehend unausgesprochen.
Nach dem Zweiten Corellianischen Aufstand änderte sich dies. Unter Imperator Fel I., der den alten Kaisertitel annahm, leitete das Imperium das "Sieg ohne Krieg"-Programm ein und machte Bastion zu einer der am stärksten befestigsten Welten der ganzen Galaxis.
Jahre später schloß das Imperium ein Bündnis mit dem neuen Sith-Orden, der die Bemühungen der Galaktischen Allianz hintertrieb, von den Yuuzhan-Vong umgeformte Welten in ihren früheren Zustand zurückzuverwandeln. Schnell trugen die Sabotageakte der Sith Früchte, als sich die Galaktische Allianz, wie einst die alte Republik, einer Abspaltungsbewegung gegenübersah. Das Imperium nutzte die Gunst der Stunde, um Mitgliedswelten der Allianz in seinen Herrschaftsbereich einzuladen. Viele Welten folgten diesem Ruf. Doch das Imperium wollte die ganze Galaxis unter seiner Herrschaft vereinen, vor allem die alte Hauptwelt Coruscant.
Auf der Welt Anaxes, der zentralen Verteidigungsbastion der Kernwelten, unterzeichnete der Muftirat den Vertrag von Anaxes, der etwa 127 Jahre nach der Schlacht von Yavin zum Sith-Imperialen Krieg führte, in dessen Verlauf Coruscant eingenommen und das Imperium wieder zur vorherrschenden Macht in der Galaxis wurde. Die übrigen Allianzwelten wurden in das Imperium aufgenommen, doch die Raumflotte der Allianz setzte ihren Kampf gegen das wiedererstarkte Imperium ähnlich wie einst die Rebellen-Allianz im Galaktischen Bürgerkrieg fort. Nur kurze Zeit nach dem Fall der Allianz forderte Kaiser Fel III. die Kapitulation des Jedi-Ordens; die Ritter der Allianz sollten sich dem Willen seines Imperiums beugen. Einige Jedi folgten dem Ruf des Kaisers und wurden zu Imperialen Rittern, doch viele andere blieben der Macht treu und flohen nach Ossus, in ihren alten Ordenssitz.
Die Sith sahen dieser Entwicklung währenddessen nicht untätig zu. Sie verfolgten die Jedi nach Ossus, und an einem schwarzen Tag für die Galaxis, der als das Massaker von Ossus in die Geschichtsbücher einging, wurden die Jedi einmal mehr so gut wie ausgerottet. Nun verrieten die Sith auch ihre imperialen Verbündeten und zettelten einen Staatsstreich gegen Roan Fel an. Unter Führung von Darth Krayt stürmten die Sith den Palast auf Coruscant und töteten den Kaiser. Die Angehörigen des Muftirats reagierten zunächst zornig, beugten sich jedoch bald dem Willen des neuen Kaisers und die Sith herrschten erneut über die Galaxis.
Doch bald erwies sich der Staatsstreich als wenigstens teilweiser Fehlschlag: der Mann, den die Sith ermordet hatten, war ein bloßer Doppelgänger gewesen, der wahre Roan Fel war entkommen. In den folgenden Jahren gelang es dem wahren Kaiser, seine ihm treu ergebenen Truppen auf die alte Thronwelt Bastion zu verlagern, die er 137 Jahre nach der Schlacht von Yavin persönlich in Besitz nahm. Fel erwartete dabei zurecht, daß Darth Krayt vor einem direkten Angriff auf die schwer befestigte Welt zurückschrecken würde. So hielt die ganze Galaxis den Atem an und wartete auf eine Entscheidung im innerimperialen Machtkampf...