Abenddämmerung senkt sich auf die Galaxis. Die großen Konflikte mit Exar Kun, den Mandalorianern und den Sith haben die Fundamente der Republik zerstört. Nur unter größten Anstrengungen hält sie sich nun noch am Leben. Auf DANTUIN werden die Aufbaubestrebungen der überlebenden Siedler von der Gier und dem Machthunger von Söldnergruppen bedroht, während die Wiederbelebung der von Darth Malak und Admiral Saul Karath verheerten Welt TELOS unter den Konzerninteressen des Czerka-Unternehmens zerrieben zu werden droht. Das einst unabhängige ONDERON hat sich nach den Bestienkriegen der Republik angeschlossen, doch der pro-republikanische Kurs seiner jungen Monarchin ist heftig umstritten. Ein dunkler Schatten beginnt, die Welt und ihre Hauptstadt Iziz zu überziehen.
In dieser Zeit der größten Herausforderungen für die Republik kehrt der Jedi, der sich nach der Schlacht von MALACHOR V von seinem Orden abgewandt hatte und danach vom Rat der Jedi verbannt worden war, zurück in den republikanischen Weltraum. Doch DARTH SION, einer der Schüler der, unter dem Sith-Namen DARTH TRAYA von Malachor V aus operierenden, gefallenen Jedi KREIA, jagt den Exilanten ohne Gnade. Nach dem Massaker auf KATARR, der Welt der Mirakula, halten die Sith diesen Exilanten für den Letzten der Jedi. Sein Tod oder sein Fall, so glauben sie, wird das Schicksal der Galaxis besiegeln. Doch nicht nur Darth Sion und Darth Nihilus suchen den Exilanten, auch Kreia sieht in ihm den Vorboten ihres Schicksals. Sie ist fasziniert von diesem Jedi, der scheinbar ohne die Macht leben kann und will ihn für ihre Zwecke nutzen: erst von den Jedi, dann von den Sith in die Verbannung getrieben, ist es ihr Ziel, die Macht selbst zu vernichten, um durch das Ende der Macht Jedi und Sith gleichermaßen für ihre Selbstherrlichkeit und Blindheit zu bestrafen.
Im letzten Augenblick gelingt es Kreia, den Exilanten vor Sions Attentätern zu bewahren. Schwer beschädigt flieht sie mit der EBON HAWK, dem alten Schiff Darth Revans, das dessen früherer Droide T3-M4 auf Revans Geheiß aus den Unbekannten Regionen zurückgebracht hat, um den Exilanten zu Revan zu führen, ins Peragus-System. Auf der dortigen Minen-Raumstation können T3, der Exilant und Kreia das Schiff reparieren und sich mit Mühe und Not erneut in letzter Sekunde dem Zugriff der Sith-Attentäter Darth Sions entziehen. Der Exilant und seine jüngsten Verbündeten, unter ihnen der frühere Sith-Folterknecht ATTON RAND, fliehen nach Telos. Nach der Beilegung des Konflikts zwischen der Czerka und den ithorianischen Heilern der Welt, trifft der Ex-Jedi dort BAO-DUR, der einst auf sein Geheiß hin MALACHOR V zerstörte, um so die Mandalorianischen Kriege zu beenden. Mit der Hilfe des alten Getreuen findet der Exilant die Jedi-Meisterin ATRIS, die in den Polarregionen des Planeten eine neue JEDI-AKADEMIE aufgebaut hat. Doch Atris heißt ihren verlorenen Schüler nicht mit offenen Armen willkommen: kalt, arrogant und voller Haß für die Kriegslüsternheit des Exilanten am Vorabend des Mandalorianischen Konflikts befiehlt sie ihm, die Akademie und ihre Welt zu verlassen. Ihre jüngste Schülerin, BRIANNA, jedoch ist fasziniert von dem Exilanten und schließt sich ihm an.
Eine geheime Hologrammaufzeichnung des Ratsbeschlusses über den Exilanten aus den Archiven der Akademie führt die Gruppe auf die Spur der letzten überlebenden Meister des Jedi-Ordens. Der Exilant will erfahren, wieso der Rat der Jedi ihn in der Macht geblendet hat und die verantwortlichen Meister zur Rede stellen. Auf Korriban, Nar Shaddaa, Dantuin und Onderon spürt er sie auf und stellt sich nicht nur ihnen, sondern dem Todeskampf der Republik auf diesen Welten. Unterstützt unter anderem von Kreia, Atton, Brianna, Darth Nihilus' Sithschülerin Visas und dem großen Mandalore findet er jedoch auch Hinweise auf einen größeren Konflikt, der den Kampf zwischen Sith, Jedi und der Republik als bloßes Scheingefecht zu enthüllen scheint: in den UNBEKANNTEN REGIONEN wartet ein neuer, noch viel tödlicher Feind, dessen Bekämpfung das oberste Ziel Revans gewesen war. Für den Aufbau einer neuen, stärkeren Abwehrfront hatte Revan die Republik herausgefordert und war nach dem Sieg über Darth Malak auf der Sternenschmiede dorthin zurückgekehrt.
Schwerer als diese Erkenntnis wirkt nur das Ringen des Exilanten mit sich selbst und seiner eigenen Vergangenheit. Auf Malachor V hatte er auf Revans Geheiß den Krieg gegen die Mandalorianer beendet, doch als Jedi mit der Macht verbunden hatte die LEERE DES PLANETEN in ihm ein Echo gefunden. Er selbst war der Forthall Malachors geworden und hatte das Echo jener letzten Schlacht durch die ganze Galaxis getragen. Nach seinem Sieg über Darth Nihilus am Himmel über Telos, kehrt der Exilant deshalb zum Ausgangspunkt seiner Reise zurück. Auf Malachor V stellt er sich mit Darth Traya seiner Vergangenheit und besiegelt das Schicksal der Sith, der Jedi und der Republik, bevor er, Revans Fährte folgend, in den wahren, den eigentlichen Krieg um das Schicksal der Galaxis aufbricht: hinaus in die Unbekannten Regionen.
Die Teile IX bis XIII enthalten Vorabinformationen (Spoiler) über Knights of the Old Republic und Knights of the Old Republik II: The Sith Lords.