Bei den aktuellen Comics kann ich dir nur Amazon empfehlen. Praktisch ist vor allem, dass du hier auf SWU im Literaturbereich dir geordnet alles angucken kannst und über einen Direktlink auf die Aamzon-Seite kommst. Schnell bestellen und die Sachen sind meist innerhalb von zwei Tagen in deinem Postfach. Da es sich bei den Comics um "Bücher" handelt, dürften die auch versandkostenfrei sein und dann gehts echt nicht besser. Der Shop nimmt genau dasselbe wie alle anderen Läden und bringt es dir direkt vor die Haustür. für faule Leute oder jene auf dem Land also.

Nun meine Comics kauf ich zwar auch "beim Laden um die Ecke", der Sammlerecke, oder bei Amazon. Doch mein "kleiner" Laden hat wohl eines der größten Comic Antiquierate in Deutschland. Die haben ihr Lager auf drei Stockwerken, verkaufen zum Teil englische Comics, haben auch gebrauchte Ware (halber Preis, auch wenn sie es neuerdings nach Gewicht verkaufen, 10€/kg.) Ebenso kann man dort auch Sachen reservieren und neuere Sachen aus dem Ausland bestellen.
Und er hat einen Onlineshop. Der ist so der größte Comicfachhandel den ich kenne.

In Esslingen , das ist ~20km von Stuttgart entfernt.

Da solltest du es wohl am besten grob nach Timeline anordnen. Dann sollten auch so gut wie alle Reihen beieinander stehen. Außer den Essentials, da dort ja verschiedene Comics neu veröffentlicht werden.
Aber du kannst ja auch die Sammelbänder, Classics und Essentials voneinander trennen, wenn es optisch besser aussieht.

Für Sammelbände: Siehe oben. Da ist Amazon in der Tat die beste Wahl.

Für Kuriositäten und anderes, hier (zum inzwischen dritten Mal in diesem Forum ) drei in der Vergangenheit gute Anbieter:

Black Dog Comics
X-Comics
Andis Comic-Express

Was das englischsprachige 70er-Material und sonstige Sammlerstücke angeht, hat sich in den vergangenen Jahren eigentlich gezeigt, dass der Kauf von Originalheften oder -bänden nicht wirklich sinnvoll ist, weil Dark Horse in den Omnibus-Megasammelbänden regelmäßig altes Material kostengünstig und gut aufbereitet neu auflegt. Ich habe bsp. noch den Fehler gemacht, mir die Comics zum Sithkrieg einzeln zu kaufen, und 12 Monate später kamen zwei Omnibus-Bände auf den Markt.
Bei den deutschen Comics sieht es natürlich anders aus, da bringt Panini nur das Material, was schon beim ersten Durchgang gezogen hat nochmal (und nochmal und nochmal ). Sachen wie die ersten Quin&-Aayla-Comics sind meines Wissens bis heute kein zweites Mal veröffentlicht worden. Auf der anderen Seite gibt es auch hier Retroveröffentlichungen, ob in Form der Essentials oder aktuell der Classics.

Deine letzte Anfrage bezüglich des Ordnens verstehe ich nicht so hundertprozentig. Eine Legacy-Übersicht findest Du bsp. hier, die Classics hier.